微生物肥料在土壤中究竟起到什么作用呢？
一是土壤的“改良師”。微生物將動植物殘體作為食物，將其分化成越來越小的分子，這就是腐殖質，是很豐富很多面的植物營養來源，它能夠吸收比自己多十幾倍的水分，很多植物需要的氮鉀等礦物營養也溶解其中，這樣大自然中的水分、養分得以更多的保存在土壤里。微生物利用富含水分、養分的腐殖質黏結礦物質（比如沙粒）蓋起了一個個自己賴以生存的房子——這就是團粒結構。團粒結構越多，土壤越松軟，保水性、保肥性越高。
二是“養分轉化師”。微生物在自己搭建的房子里辛勤勞作，它們吸收利用水分、空氣、礦物質，而分化轉化后的東西正是植物可以吸收的各種營養物質！于是奇跡出現了：各種植物在豐富營養的哺育下快樂的開花，茁壯的生長，生機盎然！
三是土壤的“凈化師”。微生物在其繁殖和代謝過程中，可以降解土壤中殘留的化肥、重金屬和別的污染物等，在其理化反應中對上述污染物質進行分化、轉化、固定、轉移以及新的無害化合成，把他們分化成低害甚至無害的物質，從而降低土壤污染的程度。
四是土壤的“療理師”。土壤中的微生物，例如抗生性微生物，它們能夠分泌生物調節劑，制止病原微生物的繁殖，這樣就可以防育和減少土壤中土傳病害微生物對作物的危害，提高作物產量和品質。農作物能夠與很多有益菌建立協作共生的關系，比如菌根，在作物根系表面生成一層菌膜，保護了根系免遭病原菌侵染，菌的分支很長，可以吸收更多營養與根系分享。
五是土壤的“營養師”。植物生長需要鉀。但在土壤中，他們絕大多數是以不溶物狀態存在的，例如鉀長石，植物無法利用，而膠質芽孢桿菌、巨大芽孢桿菌等就像一群長有鐵嘴鋼牙的部隊，將鉀長石這塊硬骨頭慢慢溶解，“磨爛嚼碎”，化為可溶的鉀元素，植物便可輕松吸收。而根瘤菌將空氣中的氮加工成可供植物吸收的氨態氮，不斷的輸送給植物，形成植物的自然氮工廠。
正是因為微生物的這些功能，讓它在土壤改良中發揮著重要的作用，成為名副其實的農業守護神。
微生物肥料包含三類，即：微生物菌劑、生物肥、復合微生物肥料。我國農業每年廢棄的可以加工成上億t的微生物肥，這樣不僅減少環境污染，而且這么多的微生物肥施入土壤，創造良田，進而提高肥料利用率，讓作物健康茁壯，病蟲害也會大大減少。
我們的土地和農作物在呼喚、我們的農民在期盼、我們的環境在期待——菌肥時代的到來！
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